两者的区别有，第一，武进区有区政府，经开区只有管委会，第二，武进区发展早，基础产业比较好，经开区发展晚，基础产业较少，第三，管辖区域不同，武进区下辖区域较多，经开区较少。
常州经开区，全称常州经济开发区，前身是江苏省常州戚墅堰经济开发区，位于常州东部，地处长三角经济圈的核心，下辖3个街道、3个镇，属于常州市中心城区。
武进区是常州市辖区，下辖11个镇、5个街道、1个国家级高新区、1个省级高新区、2个省级经济开发区、1个省级旅游度假区、1个省级现代农业产业园区。
常州，又称龙城，是江苏省下辖地级市，地处中国华东地区、江苏省南部、长三角腹地，下辖5个区、代管1个县级市，总面积约有4385平方千米。
常州：行政区划仍属武进，由功能区代管的街道乡镇，横林等地在列
经济开发区、高新区等是常见的功能区，都属于“开发区”的行列。由于顺应实际发展的需要，目前由功能区代管乡镇和街道的做法已经非常普遍。以经济开发区和高新区这两大常见的功能区为例，绝大部分城市的经济开发区、高新区都具备社会事务职能，有自己代管的乡镇。
之所以用“代管”或“委托管理”，是因为经济开发区并非行政区划意义上的市辖区，而是一座派出机构，他们没有自己的区政府、人大等完整的“班子”，而是由当地政府的派出机构—管委会行使管理职能。
在常州，武进区仍是行政区划面积最大的市辖区，在2002年时撤市设区，2015年时行政区划再做调整。作为常州市曾经的附郭县和母县，武进在常州市辖区、常州主城区的扩张进程中做出了巨大的土地和人口贡献。从1983年全省实行市管县体制后新北区的设立和天宁区、钟楼区的扩容均是从武进整建制划出乡镇并入。
例如现在的钟楼区邹区镇，天宁区郑陆镇，新北区的奔牛镇均是从武进区整建制划入。
以上乡镇的调整是人财物和土地整建制的“改换门庭”，而武进区的戚墅堰、丁堰、潞城3街道和横山桥、横林、遥观镇3镇则是“不完全脱离”武进的状态——由常州经济开发区代管。
戚墅堰、丁堰、潞城3街道原属戚墅堰区，2015年4月与武进合并为新的武进区。在同年的1月份，即2区未合并前，以整个戚墅堰区的区划范围为依托的戚墅堰经济开发区正式更名为常州经济开发区，变成由常州市级直属但不直管的开发区。同时将武进区的横山桥、横林、遥观镇划入常州经济开发区代管实现开发区扩容，但3镇在行政区划上仍属武进区。
2区合并后，常州经济开发区完全变成了完全位于武进区境内的开发区，管理体制暂停留在市直属、武进区直管的状态。3街道3镇虽然仍由经开区代管，但各项事务和行政区划仍属于武进区。
2019年底对于常州经济开发区管理体制改变则是3镇3街道“不完全脱离”武进区这一状态的开始。按照新的体制，从2020年1月1日起，常州经开区除了人大、政协、人武部仍在武进区，其余所有事务均直接对应常州市级，独立于武进区外。
例如在第七次人口普查公报中，常州经开区人口单列，未计入武进区。
对于戚墅堰、横林等3镇3街道而言，由于实际管理它们的常州经开区目前只是一个市级派出机构，并非是天宁、武进等行政区划意义上的市辖区，所以在行政区划和地图上，6地仍然位于武进区。
